选择性肠道灭菌( selective decontamination of the digestive tract,SDD)的目的是预防或清除(若以前存在)口咽部和胃肠道携带的PPM(尤其是医院PPM)以及金黄色葡萄球菌和类酵母菌,保留固有菌群,因为后者被认为在对抗PPM定居方面起重要作用。
SDD需要联合使用口服不能吸收的抗生素,以消灭PPM,同时不影响固有菌群。SDD的目的在于控制继发性内源性感染最常选择的药物为多粘菌素E、妥布霉素和二性霉素B(PTA),使用时口咽部涂PTA膏(或凝胶、糖锭),胃肠道使用悬液。但是,仅用PTA对原发性内源性或外源性感染并无影响。同时应用胃肠外使用的抗生素可以预防原发性内源性感染。