如果人类肠道中的微生物对免疫系统也有这种作用，那么将来有一天研究人员也许能够利用肠道内的微生物来进行治疗。
　　IBD患者体内某些种类的梭状芽胞杆菌没有健康人那么多，提示这些梭状芽胞杆菌在维持正常的消化功能中发挥了作用。此外，研究还证明，Tregs的免疫应答在变态反应、哮喘和许多慢性疾病状态的发生发展过程中非常重要，因此，具有足够数量的这些细菌和其它一些细菌对维持适当的微生物平衡，从而产生一个恰当的免疫平衡至关重要。
　　如果能够确定这些细菌介导免疫应答的机制，则对于IBD和包括变态反应性疾病在内的其它疾病，有可能建立新的治疗策略。