由中国工程院院士、中国医学科学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室詹启敏教授研究团队与华大基因、汕头大学医学院等单位的科研人员合作，通过高通量测序、比较基因组杂交芯片分析、生物学功能和临床验证研究，全面系统地揭示了食管鳞癌的遗传突变背景，发现了与食管鳞癌发生发展进程和临床预后相关的基因，为了解食管鳞癌的发病机制，寻找食管鳞癌诊断的分子标志物，确定研发临床治疗的药物靶点以及制定有效的治疗方案提供了理论和实验依据。研究论文2014年3月16日在线发表于《自然》(Nature)杂志。

    詹院士研究团队利用基因组学、生物信息学、分子生物学、临床病理学理论和技术，结合我国食管鳞癌患者样本和临床信息，开展了全面、深入的研究。

    研究人员发现了8个与食管鳞癌发生相关的重要的基因突变，其中FAM135B是首次发现的肿瘤相关基因;同时获得了食管鳞癌拷贝数变异的重要数据，发现位于染色体11q13.3-13.4扩增区域的MIR548K参与食管鳞癌的恶性表型的形成。这些基因突变和拷贝数的变异是食管癌发生发展的重要因素，与临床食管癌患者的预后密切相关。

    该项研究还发现重要组蛋白调节基因MLL2、ASH1L、MLL3、SETD1B和CREBBP/EP300在食管鳞癌中呈现频繁非沉默突变。研究人员对潜在治疗靶点进行分析，发现PI3K是食管鳞癌突变频率最高的潜在药靶，以及PSMD2、RARRES1、SRC、GSK3β和SGK3等潜在新药靶。研究人员整合了所有基因突变和基因拷贝变异数据，确定了与食管鳞癌发生发展相关的重要信号通路，包括Wnt、cellcycle、Notch、RTK-Ras和AKT通路。

    詹院士指出：“该研究是我国多个科研团队通过协同创新的方式，结合国家在肿瘤防控领域的重大需求，针对具有我国特色的食管癌开展的一项科研工作。该研究从创新的视野和系统的层面，描绘了我国高发食管鳞癌基因组异常改变的全景。研究成果为了解食管鳞癌的发生发展机制提供了新思路，为研发特异性治疗食管癌药物，制定有效的临床诊断和治疗食管癌方法提供了科学依据。”