ICU的住院时间是所有医院感染的主要危险因素。EPIC的资料显示,住ICU3~4天的患者获得感染的危险性较1~2天者高3倍,住ICU5~6天者感染的危险性增加到6倍,而住ICU3周以上的患者发生感染的危险性更高达33倍。不仅如此,ICU的住院时间还能显著影响感染的致病菌。概言之,社区获得性感染与早期发生的医院感染(即住院4天内获得的感染)常常由肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肠杆菌(如大肠杆菌、变形杆菌和肺炎克氏菌)、甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌、链球菌和厌氧菌引起。相反,后期发生的医院感染(即住院4天后获得的感染致病菌常常高度耐药,包括肠杆菌属、沙雷杆菌属、产生超广谱β内酰胺酶(ESBL)的细菌、铜绿假单胞菌、不动杆菌属、甲氧西林耐药的金黄色葡萄球菌(MRSA)、肠球菌和真菌。在法国一家医院ICU的爆发流行中,产ESBL的肠杆菌导致感染的危险性在住ICU第1周为4.2%,在第4周则上升到24%。