甲硝唑在抗厌氧菌方面有强大作用，属于一种用途广泛的平价药。在不同部位疾病的选择上，甲硝唑有它最适宜的剂型。
　　妇科滴虫感染。甲硝唑对**滴虫有直接杀灭作用。用法是：1%乳酸或5%醋酸冲洗**后，给予甲硝唑泡腾片200毫克，**置入，每晚1次，连用1周。反复发作的患者还可配合口服或输液用药。甲硝唑栓剂同样可用于这种疾病。
　　皮肤感染。甲硝唑可杀灭引起炎症性痤疮的厌氧菌--痤疮棒状杆菌，故对其有效。用复方甲硝唑霜（甲硝唑2克，硫磺5克，地塞美松5毫克加单纯霜至100克）治疗痤疮，效果很好。
　　口腔炎症。研究显示，成年人牙周炎时，约75%为革兰氏阴性厌氧菌所致。治疗慢性牙龈炎，可口服甲硝唑0.4克，每日3次，一周为一疗程。起效更直接的剂型是甲硝唑口颊片和甲硝唑含漱液。与硫酸锌制成复方甲硝唑溶液还可以治疗口腔溃疡。
　　消化性溃疡。甲硝唑能使胃黏膜上皮细胞及其分泌功能改善，增强胃的黏膜屏障和黏液屏障，因此可用于治疗胃溃疡和十二指肠溃疡。用法：口服每次0.4克，每日3次，疗程4周。